Tout d'abord, l'ordre de missions est indiqué par la personne donnant la mission ainsi que le type de la mission (type 1 ou type 2). Les missions se demandent dans le palais du kage, ainsi que les rapports, avec un sujet pour chacun. Un kage n'a pas le droit de refuser une mission qu'on lui demande.
Type 1: Les missions ne touchant personne
La personne demandant la mission doit d'abord dire combien de personnes effectueront cette mission (il peut très bien en avoir qu'une), ainsi que l'importance de la mission ( D, C, B, A, S). Le kage donne ensuite le lieu où la mission sera effectué. Ces missions là n'engendrent que les personnes effectuant la mission.
Type 2: Les assauts
Ces missions là sont plus importantes que les missions de type 1, en effet, les missions de type 2 engendrent d'autres personnes que celle effectuant la mission. Elles consistent à par exemple surveiller, voir même éliminer quelqu'un devenu génant. Ca peut très bien être un chunin embétant trop des genin qu'il faut recadrer, ou un déserteur ayant élu domicile dans le village ou au alentour, ou même une personne figurant sur le bingo book à éliminer.